Programmbereich Infektionen

Molekulare und Experimentelle Mykobakteriologie

Mission    Projekte    Drittmittel    Methoden    Publikationen    Mitarbeiter/innen

Methoden

• Standardisierte Kultursysteme für die Analyse von klinischen M. tuberculosis Isolaten (auch große Mengen)
• Standardisierte Methoden für die Isolierung von genomischer DNA, RNA und intrazellulärem Protein
• Molekularbiologische Methoden für die Analyse genomischer DNA und RNA (Agarose Gel Elektrophorese, Southern Blot, PCR, Real Time PCR, DNA-Sequenz-Analyse, Microarray)
• Genotypisierung von M. tuberculosis-Komplex-Isolaten mittels IS6110-DNA-Fingerprint
• Spoligotyping
• Mycobacterial Interspersed Repetitive Units-Variable Number of Tandem Repeats (MIRU-VNTR)-Analyse
• Analyse von Großen Sequenzpolymorphismen (“Regions of Difference”).
• Analyse von Punktmutationen („Single Nucleotide Polymorphisms“)
• Genexpressionsanalysen von M. tuberculosis-Komplex-Isolaten mittels: Real-Time PCR
• Gesamtgenom Expressionsanalysen mittels Microarray
• Generierung von M. tuberculosis GVO (S3)
• Bioinformatische Analyse und Archivierung von Typisierungsdaten mit der Bionumerics Software
• Bioinformatische Analyse von Sequenzdaten mit verschiedenen Spezialprogrammen (Seqscape, Lasergene, GenDB)