Histologie
Schwerpunkt
Im Rahmen der Core Unit führen wir histologische Arbeiten an Tiermodellen durch, die in Projekten des FZBs bearbeitet werden. Neben Beratung bei der Präanalytik bearbeiten wir Gewebe für die Einbettung in Paraffin, Herstellung von Schnitten, histologische Färbungen, Immunhistochemie und Archivierung des Blockmaterials. Gefrierschnitte sind ebenso Bestandteil der Tätigkeiten. Wir arbeiten im Rahmen der Archivierung eng mit der BMB Nord zusammen. Gerne beraten wir die verschiedenen FGs bei der Planung und Durchführung histologischer Analysen, sowie weitergehender Untersuchungen wie Transcriptomics, multispektrale IHC, Nanostring und Spatial Transcriptomics.
Forschung
Wir sind im Rahmen des Deutschen Zentrums für Lungenforschung (DZL) am Standort Nord (ARCN) in drittmittelgeförderte Projekte der Disease Areas Lung Cancer, COPD, Asthma/Allergie und Biobanking eingebunden. Ein besonderer Schwerpunkt liegt auf Untersuchungen des TGF-beta-Signalweges in NSCLC, zunehmend werden embryologische Prozesse sowie das Tumor-Microenvironment relevant. Nach jahrelanger Grundlagenforschung beschäftigen wir uns mittlerweile intensiv mit der Translation der hier gewonnenen Ergebnisse in die Klinik. Im Bereich Infektion interessiert uns besonders die multispektrale immunhistochemische Analyse von pathophysiologischen Events in Tuberkulosegranulomen sowie Transkriptomuntersuchungen innerhalb verschiedener Modellsysteme und Kohorten, mit dem Ziel einer Entwicklung von host directed therapies.
- DZL LC central project Tumor microenvironment in Lung Cancer
Cooperation with R. Savai (MPI Bad Nauheim), Univ. Heidelberg (M. Thomas, H. Winther, P. Christopoulos), DKFZ (U. Klingmüller), Lungenclinic Grosshansdorf (M. Reck, K.F Rabe, H. Watz), Univ. Lübeck (D. Drömann). Univ. München (A. Tufmann). - DZL-DZIF overarching project: Multispectral Immunohistochemistry, Transcriptomics and Epigenetics in Tuberculosis
Cooperation with A. Blumenthal (Univ. Queensland, Australia), T. Dallenga, U. Schaible, N. Shubladze (Univ. Tblisi, Georgia) C. Lange, Ch. Hölscher, S. Niemann and N. Reiling. - DZL LC basic science flagship project: TGF beta signaling in NSCLC
Cooperation with MPI Bad Nauheim (R. Savai, Pirfenidone), CPC-München (G. Stathopoulos, SMAD-Linker) und DKFZ (U. Klingmüller) and LungenClinic Grosshansdorf (M.Reck, K.F. Rabe), Univ. Lübeck (D. Drömann). - DZL LC translational flagship project: Epigenetics of NSCLC
Cooperation with Univ. Ulm (O. Ammerpohl), Lungenclinic Grosshansdorf (M. Reck, K.F. Rabe) - DZL LC COPD and AA
Cooperation with LungenClinic (H. Watz, K.F. Rabe), Univ. Ulm (O. Ammerpohl), D. Schwudke, S. Krauss-Etschmann, U. Jappe, S. Meiners, H. Heine, K. Stein, M. Wegmann, F. Petersen, A. Frey, H. Fehrenbach and K. Brandenburg. - BMBF Indicate FH
Histology, Transcriptomics and Methylomes in Wheat Allergy and Hypersensitivity. Cooperation with U. Jappe, Th. Kufer (Univ. Stuttgart), S. Bischoff (Univ. Stuttgart), Christian Sina (Univ. Lübeck).
Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF)
- Deutsches Zentrum für Lungenforschung (DZL), Airway Research Center North (ARCN),
Disease Area LC (Lung Cancer). Projektdauer: 1.1. 2021 – 31.12.2023. - Deutsches Zentrum für Lungenforschung (DZL), Airway Research Center North (ARCN),
Disease Area COPD (COPD). Projektdauer: 1.1. 2021 – 31.12.2023. - Deutsches Zentrum für Lungenforschung (DZL), Airway Research Center North (ARCN),
Platform Biobanking. Projektdauer: 1.1. 2021 – 31.12.2023. - Indicate FH. Projektdauer: 2022-2025.
Wir arbeiten primär an histologischem Material. Dessen Aufarbeitung (FFPE, Gefrier, HOPE) ist unser zentrales methodisches Fundament. Neben konventionellen histologische Färbetechniken arbeiten wir häufig und regelmäßig mit immunhistochemischen Färbemethoden.
- Multispektrale Immunistochemie und Spatial Transcriptomics
Wir sind hocherfreut, durch eine Förderung des DZL eine multispektrale immunhostochemische Plattform zur Verfügung zu haben (Akoya Vectra-Polaris), welche neben unseren anderen Technologien (Transkriptom, Nanostring, Zellkultur) das methodische Portfolio entscheidend erweitert. Zusätzlich ist es gelungen, gemeinsam mit der FG Frühkindliche Asthmaprägung eine Plattform für Spatial Transcriptomics (10x) einzuwerben. - Transkriptomanalysen
Methodisch bieten wir neben Trancriptomics auf unserer DZL-finanzierten Agilent-Plattform (inkl. Bioanalyzer und Nanodrop) Untersuchungen auf dem Nanostring N-Counter an, hier verfügen wir über eine Prep-station. Außerdem verfügen wir über einen Light Cycler. - Zellkultur
Wir arbeiten mit verschiedenen Zellsystemen, um funktionale Studien zu ermöglichen. Hierzu gehören neben Zelllinien auch humane Primärzellkulturen (in Zusammenarbeit mit der Lungenclinic Grosshansdorf). Entsprechende Read out Systeme sind Western Blot, In Cell Western und Fluoreszenzmikroskopie.
2024
Höhne, K, Wagenknecht, A, Maier, C, Engelhard, P, Goldmann, T, Schließmann, SJ, Plönes, T, Trepel, M, Eibel, H & Zissel, G 2024, 'Pro-Fibrotic Effects of CCL18 on Human Lung Fibroblasts Are Mediated via CCR6', Cells, Jg. 13, Nr. 3, 238. https://doi.org/10.3390/cells13030238
Kuempers, C, Schnepf, K, Marwitz, S, Watermann, C, Scheel, A, Fischer, RN, Ammerpohl, O, Perner, S, Drömann, D & Goldmann, T 2024, 'Upregulation and epigenetic modification of the creatine transporter SLC6A8 in non-small cell lung cancer', Histology and histopathology, S. 18731. https://doi.org/10.14670/HH-18-731
Richtmann, S, Marwitz, S, Muley, T, Koistinen, H, Christopoulos, P, Thomas, M, Kazdal, D, Allgäuer, M, Winter, H & Goldmann, T et al. 2024, 'The pregnancy-associated protein glycodelin as a potential sex-specific target for resistance to immunotherapy in non-small cell lung cancer', Translational Research. https://doi.org/10.1016/j.trsl.2024.02.007
2023
Chen, J, Wang, X, Schmalen, A, Haines, S, Wolff, M, Ma, H, Zhang, H, Stoleriu, MG, Nowak, J, Nakayama, M, Bueno, M, Brands, J, Mora, AL, Lee, JS, Krauss-Etschmann, S, Dmitrieva, A, Frankenberger, M, Hofer, TP, Noessner, E, Moosmann, A, Behr, J, Milger, K, Deeg, CA, Staab-Weijnitz, CA, Hauck, SM, Adler, H, Goldmann, T, Gaede, KI, Behrends, J, Kammerl, IE & Meiners, S 2023, 'Antiviral CD8+ T cell immune responses are impaired by cigarette smoke and in COPD', The European respiratory journal, Jg. 62, Nr. 2, 2201374. https://doi.org/10.1183/13993003.01374-2022
GEN-COVID Multicenter Study Group 2023, 'CYP19A1 mediates severe SARS-CoV-2 disease outcome in males', Cell reports. Medicine, S. 101152. https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101152
2022
Shan, L, Zhang, L, Zhu, X, Wang, Z, Fang, S, Lin, J, Wang, J, Li, N, Liu, H, Zhang, X, Feng, Y, Liu, J, Pan, J, Ye, G, Yu, X, Tufman, A, Katalinic, A, Goldmann, T, Petersen, F, Jiang, J, Geng, G & Yu, X 2022, 'Chinese never smokers with adenocarcinoma of the lung are younger and have fewer lymph node metastases than smokers', RESPIRATORY RESEARCH, Jg. 23, Nr. 1, S. 293. https://doi.org/10.1186/s12931-022-02199-z
Kasper, B, Yue, X, Goldmann, T, Gülsen, A, Kugler, C, Yu, X & Petersen, F 2022, 'Air exposure and cell differentiation are essential for investigation of SARS-CoV-2 entry genes in human primary airway epithelial cells in vitro', Frontiers in Medicine, Jg. 9, S. 897695. https://doi.org/10.3389/fmed.2022.897695
DZIF-TB cohort study group 2022, 'Gene expression signatures identify biologically and clinically distinct tuberculosis endotypes', The European respiratory journal, Jg. 60, Nr. 3. https://doi.org/10.1183/13993003.02263-2021
Kupsch, S, Eggers, LF, Spengler, D, Gisch, N, Goldmann, T, Fehrenbach, H, Stichtenoth, G, Krause, MF, Schwudke, D & Schromm, AB 2022, 'Characterization of phospholipid-modified lung surfactant in vitro and in a neonatal ARDS model reveals anti-inflammatory potential and surfactant lipidome signatures', European journal of pharmaceutical sciences, Jg. 175, S. 106216. https://doi.org/10.1016/j.ejps.2022.106216
Budczies, J, Kirchner, M, Kluck, K, Kazdal, D, Glade, J, Allgäuer, M, Kriegsmann, M, Heußel, C-P, Herth, FJ, Winter, H, Meister, M, Muley, T, Goldmann, T, Fröhling, S, Wermke, M, Waller, CF, Tufman, A, Reck, M, Peters, S, Schirmacher, P, Thomas, M, Christopoulos, P & Stenzinger, A 2022, 'Deciphering the immunosuppressive tumor microenvironment in ALK- and EGFR-positive lung adenocarcinoma', CANCER IMMUNOLOGY IMMUNOTHERAPY, Jg. 71, Nr. 2, S. 251-265. https://doi.org/10.1007/s00262-021-02981-w
Uchino, J, Goldmann, T & Kimura, H 2022, 'Editorial: Treatment for Non-Small Cell Lung Cancer in Distinct Patient Populations', Frontiers in Oncology, S. 838570. https://doi.org/10.3389/fonc.2022.838570
Leitung der Forschungsgruppe
Wissenschaftliche Mitarbeiter:innen
Technische Mitarbeiter:innen
